海關監管倉庫是指在海關批準范圍內，接受海關查驗的進出口、過境、轉運、通關貨物，以及保稅貨物和其他尚未辦結海關手續的進出境貨物。其實也是保稅儲存的一種類型，與外國的保稅區域的功能有類似之處，主要存放貨物以及行李物品進境而所有人未來提取，或者無證到貨、單證不齊、手續不完備以及違反海關章程，海關不予放行，需要暫存海關監管倉庫聽候海關處理的貨物。

這種倉庫有的由海關自行管理，但隨著進出口業務的增大，海關作為行政管理機關，自營諸多不便，現在基本上交由專營的倉儲企業經營管理，海關行使行政監管職能。

存放在海關監管倉庫的貨物有兩個期限，如儲存超過14天，海關要征收遲納金；超過三個月仍不提取的，便視為放棄貨物，按照《中華人民共和國海關法》的規定變賣，款項交歸國庫。