根據(jù)海關(guān)實(shí)施稽查針對(duì)的內(nèi)容和產(chǎn)生的影響，海關(guān)稽查的目標(biāo)可以分為直接目標(biāo)和最終目標(biāo)。

1．直接目標(biāo)

即海關(guān)稽查直接作用于被稽查人(企業(yè)、單位)，通過(guò)對(duì)被稽查人的會(huì)計(jì)資料、報(bào)關(guān)單證及其他相關(guān)資料和進(jìn)出口貨物的稽核，監(jiān)督被稽查人進(jìn)出口活動(dòng)的真實(shí)性、合法性。因而，所追求的目標(biāo)是具體的、有形的、現(xiàn)實(shí)的。

2．最終目標(biāo)

即通過(guò)有計(jì)劃、分步驟的海關(guān)稽查，全面規(guī)范企業(yè)的進(jìn)出口行為，提高進(jìn)出口企業(yè)守法自律意識(shí)，防范或減少企業(yè)違法行為的發(fā)生，維護(hù)正常的進(jìn)出口秩序。因而，所追求的目標(biāo)是整體的、無(wú)形的、長(zhǎng)遠(yuǎn)的。

3．實(shí)現(xiàn)海關(guān)稽查目標(biāo)的主要手段

為了防范和查究在進(jìn)出口貨物的通關(guān)過(guò)程中和在保稅貨物、減免稅貨物的海關(guān)監(jiān)管期間可能發(fā)生或者已經(jīng)發(fā)生的各種走私違法情事，引導(dǎo)和規(guī)范從事進(jìn)出口活動(dòng)的企業(yè)守法經(jīng)營(yíng)，海關(guān)在進(jìn)出口貨物已實(shí)現(xiàn)脫離其控制后的規(guī)定期限內(nèi)，以稽查的方式有針對(duì)性稽核與進(jìn)出口活動(dòng)有關(guān)的企業(yè)賬冊(cè)、文件單證等商業(yè)記錄，并實(shí)地核查有關(guān)進(jìn)出口貨物的使用情況或?qū)嶋H去向，以此保證海關(guān)對(duì)企業(yè)進(jìn)出口活動(dòng)的合法性、真實(shí)性進(jìn)行有效監(jiān)管。