1、進倉報關

保稅倉庫貨物進境入倉時，除易制毒化學品、監(jiān)控化學品、消耗臭氧層物質(zhì)外，免領進口許可證件。

(1)如果倉庫主管海關與進境口岸不是同一直屬海關的，按轉關方式來辦理，可以按“提前報關轉關方式”申報，也可以按“直轉轉關方式”申報。

(2)如果倉庫主管海關與進境口岸是同一直屬海關的，經(jīng)批準，可以不按轉關運輸方式辦理，由經(jīng)營企業(yè)直接在口岸海關辦理報關手續(xù)，口岸海關放行后，企業(yè)自行提取貨物入倉。

2、出倉報關

保稅倉庫貨物出倉可能出現(xiàn)進口報關(進入國內(nèi)市場)和出口報關(復運出口)。

(1)出口報關：保稅倉庫出倉復運出境貨物，應當按轉關運輸方式辦理出倉手續(xù)。是同一直屬海關的，經(jīng)批準，可以不按轉關運輸方式辦理。

(2)進口報關

轉為正式進口的同一批貨物，要填制兩張報關單，一張辦結出倉報關手續(xù)，由保稅倉庫經(jīng)營企業(yè)填制出口貨物報關單。另一張辦理進口申報手續(xù)，按照實際進口監(jiān)管方式，填制進口貨物報關單。進口手續(xù)大體分為：

①保稅倉庫貨物出倉用于加工貿(mào)易的，由加工貿(mào)易企業(yè)或其代理人按保稅加工貨物的報關程序辦理進口報關手續(xù)。

②保稅倉庫貨物出倉作為特定減免稅貨物的，由享受特定減免稅的企業(yè)按特定減免稅貨物的報關程序辦理進口報關手續(xù)。

③保稅倉庫貨物出倉進入國內(nèi)市場，由保稅倉庫經(jīng)營企業(yè)按一般進口貨物的報關程序辦理進口報關手續(xù)。

④保稅倉庫內(nèi)的寄售維修零配件申請以保修期內(nèi)免費出倉的，由保稅倉庫經(jīng)營企業(yè)辦理進口報關手續(xù)，填制進口報關單，貿(mào)易方式欄填“無代價抵償貨物”，并確認免稅出倉的維修件在保修期內(nèi)不超過原設備進口之日起3年。

(3)集中報關：保稅貨物出庫批量少批次頻繁，經(jīng)海關批準可以辦理定期集中報關手續(xù)。

3、流轉報關

(1)保稅倉庫與特殊監(jiān)管區(qū)域之間往來流轉的貨物，按轉關運輸?shù)挠嘘P規(guī)定辦理，保稅倉庫與特殊監(jiān)管區(qū)域?qū)儆谕轮睂訇P區(qū)內(nèi)的，可不按轉關運輸辦理。

(2)保稅倉庫貨物轉往其他保稅倉庫的，應當各自在倉庫主管海關報關，報關時先辦理進口報關，再辦理出口報關。