南京共27條地鐵線路，470個站點（含規劃），線路分別為地鐵10號線、地鐵1號線、地鐵2號線、地鐵3號線、地鐵4號線、地鐵S1號線、地鐵S3號線、地鐵S7號線、地鐵S8號線、地鐵S9號線、地鐵13號線、地鐵S8號線南延、地鐵3號線三期、地鐵S2號線、地鐵S5號線、地鐵10號線二期、地鐵11號線、地鐵9號線、地鐵5號線、地鐵S6號線、地鐵S4號線、地鐵8號線、地鐵4號線二期、地鐵7號線、地鐵12號線、地鐵6號線、地鐵7號線南段。南京地鐵具體營運時間如下：
| 線路 | 首班時間 | 末班時間 | 站點數 | |
|---|---|---|---|---|
| 地鐵10號線 | 安德門-雨山路 | 06:00 | 23:40 | 14 |
| 雨山路-安德門 | 05:40 | 23:00 | 14 | |
| 地鐵1號線 | 中國藥科大學-八卦洲大橋南 | 05:47 | 23:27 | 32 |
| 八卦洲大橋南-中國藥科大學 | 05:30 | 23:08 | 32 | |
| 地鐵2號線 | 魚嘴-經天路 | 06:00 | 23:00 | 30 |
| 經天路-魚嘴 | 06:00 | 23:00 | 30 | |
| 地鐵3號線 | 林場-秣周東路 | 05:50 | 23:00 | 29 |
| 秣周東路-林場 | 05:40 | 23:10 | 29 | |
| 地鐵4號線 | 仙林湖-龍江 | 06:00 | 23:00 | 18 |
| 龍江-仙林湖 | 06:00 | 23:00 | 18 | |
| 地鐵S1號線 | 南京南站-空港新城江寧 | 06:00 | 22:40 | 9 |
| 空港新城江寧-南京南站 | 05:57 | 22:40 | 9 | |
| 地鐵S3號線 | 南京南站-高家沖 | 06:00 | 22:00 | 19 |
| 高家沖-南京南站 | 06:00 | 22:00 | 19 | |
| 地鐵S7號線 | 無想山-空港新城江寧 | 06:00 | 22:00 | 9 |
| 空港新城江寧-無想山 | 06:00 | 22:00 | 9 | |
| 地鐵S8號線 | 長江大橋北-金牛湖 | 17 | ||
| 金牛湖-長江大橋北 | 06:00 | 22:00 | 19 | |
| 地鐵S9號線 | 翔宇路南-高淳 | 06:00 | 22:00 | 6 |
| 高淳-翔宇路南 | 06:00 | 22:00 | 6 | |
| 地鐵13號線 | 彤天路-沿山大道 | - | - | 33 |
| 沿山大道-彤天路 | - | - | 33 | |
| 地鐵S8號線南延 | 長江大橋北-泰山新村 | - | - | 3 |
| 泰山新村-長江大橋北 | - | - | 2 | |
| 地鐵3號線三期 | 秣陵街道-秣周東路 | - | - | 3 |
| 秣周東路-秣陵街道 | - | - | 3 | |
| 地鐵S2號線 | 寧馬線)(在建)(當涂南-西善橋 | - | - | 16 |
| 寧馬線)(在建)(西善橋-當涂南 | - | - | 16 | |
| 寧馬線)二期(中華門-西善橋 | - | - | 5 | |
| 寧馬線)二期(西善橋-中華門 | - | - | 5 | |
| 地鐵S5號線 | 寧揚線)(揚州西站-仙林湖 | - | - | 16 |
| 寧揚線)(仙林湖-揚州西站 | - | - | 16 | |
| 地鐵10號線二期 | 東麒路-安德門 | - | - | 11 |
| 安德門-東麒路 | - | - | 11 | |
| 地鐵11號線 | 浦洲路-馬騾圩 | - | - | 20 |
| 馬騾圩-浦洲路 | - | - | 20 | |
| 地鐵9號線 | 江蘇大劇院·憲法廣場-紅山新城 | - | - | 16 |
| 紅山新城-江蘇大劇院·憲法廣場 | - | - | 16 | |
| 地鐵5號線 | 文靖路-吉印大道 | - | - | 29 |
| 吉印大道-文靖路 | - | - | 30 | |
| 地鐵S6號線 | 寧句線)(句容-馬群 | 06:00 | 22:00 | 13 |
| 寧句線)(馬群-句容 | 06:00 | 22:30 | 13 | |
| 地鐵S4號線 | 寧滁線)(滁州高鐵站-南京北站 | - | - | 17 |
| 寧滁線)(南京北站-滁州高鐵站 | - | - | 17 | |
| 地鐵8號線 | 中華門-十月廣場 | - | - | 20 |
| 十月廣場-中華門 | - | - | 20 | |
| 地鐵4號線二期 | 龍江-珍珠泉 | - | - | 7 |
| 珍珠泉-龍江 | - | - | 7 | |
| 地鐵7號線 | 西善橋-仙新路 | 18 | ||
| 仙新路-西善橋 | - | - | 18 | |
| 地鐵12號線 | 金馬路-牛首山 | - | - | 20 |
| 牛首山-金馬路 | - | - | 20 | |
| 地鐵6號線 | 棲霞山-南京南站 | - | - | 20 |
| 南京南站-棲霞山 | - | - | 20 | |
| 地鐵7號線南段 | 應天大街-西善橋 | - | - | 18 |
| 西善橋-應天大街 | - | - | 18 | |
本市的地鐵經過南京11個地區，分別為(括號為地鐵站個數)：雨花臺區（33個）、建鄴區（41個）、浦口區（66個）、江寧區（85個）、秦淮區（45個）、鼓樓區（56個）、玄武區（32個）、棲霞區（51個）、溧水區（10個）、六合區（13個）、高淳區（2個）。
南京地鐵線路圖