深圳共29條地鐵線路，501個站點（含規劃），線路分別為地鐵10號線、地鐵11號線、地鐵1號線、地鐵20號線、地鐵2號線、地鐵8號線、地鐵3號線、地鐵4號線、地鐵5號線、地鐵6號線、地鐵7號線、地鐵9號線、深惠城際大鵬支線、深大城際、地鐵11號線二期、深惠城際、地鐵6號線支線二期、地鐵6號線支線、地鐵3號線東延線、地鐵5號線西延線、地鐵16號線、地鐵14號線、地鐵13號線、地鐵12號線、地鐵8號線三期、地鐵8號線二期、地鐵15號線內環、地鐵7號線二期、地鐵15號線外環。深圳地鐵具體營運時間如下：
| 線路 | 首班時間 | 末班時間 | 站點數 | |
|---|---|---|---|---|
| 地鐵10號線 | 坂田線)(雙擁街-福田口岸 | 06:20 | 23:00 | 24 |
| 坂田線)(福田口岸-雙擁街 | 06:17 | 23:00 | 24 | |
| 地鐵11號線 | 機場線)(碧頭-紅嶺南 | 06:20 | 23:36 | 19 |
| 機場線)(紅嶺南-碧頭 | 19 | |||
| 地鐵1號線 | 羅寶線)(機場東-羅湖 | 06:21 | 23:00 | 30 |
| 羅寶線)(羅湖-機場東 | 06:20 | 23:00 | 30 | |
| 地鐵20號線 | 會展城-機場北 | 07:00 | 22:00 | 5 |
| 機場北-會展城 | 07:00 | 22:00 | 5 | |
| 地鐵2號線 | 蛇口線)(小梅沙-赤灣 | 38 | ||
| 地鐵8號線 | 鹽田線)(赤灣-小梅沙 | 06:00 | 23:00 | 38 |
| 地鐵3號線 | 龍崗線)(坪地六聯-福保 | 31 | ||
| 龍崗線)(福保-坪地六聯 | 06:17 | 23:00 | 31 | |
| 地鐵4號線 | 龍華線)(牛湖-福田口岸 | 06:30 | 23:00 | 23 |
| 龍華線)(福田口岸-牛湖 | 06:35 | 23:00 | 23 | |
| 地鐵5號線 | 環中線)(赤灣-黃貝嶺 | 06:12 | 23:00 | 34 |
| 環中線)(黃貝嶺-赤灣 | 06:14 | 23:03 | 34 | |
| 地鐵6號線 | 光明線)(松崗-科學館 | 06:20 | 23:00 | 27 |
| 光明線)(科學館-松崗 | 06:20 | 23:00 | 27 | |
| 地鐵7號線 | 西麗線)(太安-深大麗湖 | 06:20 | 23:00 | 28 |
| 西麗線)(深大麗湖-太安 | 28 | |||
| 地鐵9號線 | 梅林線)(前灣-文錦 | 06:20 | 23:00 | 32 |
| 梅林線)(文錦-前灣 | 06:20 | 23:00 | 32 | |
| 深惠城際大鵬支線 | 龍城-新大 | - | - | 6 |
| 新大-龍城 | - | - | 6 | |
| 深大城際 | 聚龍-機場北 | - | - | 11 |
| 機場北-聚龍 | - | - | 11 | |
| 地鐵11號線二期 | 紅嶺南-崗廈北 | - | - | 4 |
| 崗廈北-紅嶺南 | - | - | 4 | |
| 深惠城際 | 前保-坪地 | - | - | 11 |
| 坪地-前保 | - | - | 11 | |
| 地鐵6號線支線二期 | 光明城-光明 | - | - | 4 |
| 光明-光明城 | - | - | 4 | |
| 地鐵6號線支線 | 光明-深理工 | - | - | 4 |
| 深理工-光明 | - | - | 4 | |
| 地鐵3號線東延線 | 雙龍-坪地六聯 | - | - | 8 |
| 坪地六聯-雙龍 | - | - | 8 | |
| 地鐵5號線西延線 | 大劇院-黃貝嶺 | - | - | 4 |
| 黃貝嶺-大劇院 | - | - | 4 | |
| 地鐵16號線 | 龍坪線)(田心-大運 | - | - | 24 |
| 龍坪線)二期(大運-西坑 | - | - | 9 | |
| 龍坪線)二期(西坑-大運 | - | - | 9 | |
| 龍坪線)(大運-田心 | - | - | 24 | |
| 地鐵14號線 | 東部快線)(崗廈北-沙田 | - | - | 18 |
| 東部快線)(沙田-崗廈北 | - | - | 18 | |
| 地鐵13號線 | 石巖線)(深圳灣口岸-高新中 | - | - | 16 |
| 石巖線)(高新中-深圳灣口岸 | - | - | 15 | |
| 石巖線)二期南延(深圳灣口岸-東角頭 | - | - | 4 | |
| 石巖線)二期南延(東角頭-深圳灣口岸 | - | - | 4 | |
| 石巖線)二期北延(上屋-公明北 | - | - | 12 | |
| 石巖線)二期北延(公明北-上屋 | - | - | 12 | |
| 地鐵12號線 | 南寶線)(左炮臺東-松崗 | - | - | 33 |
| 南寶線)二期(松崗-海上田園東 | - | - | 7 | |
| 南寶線)二期(海上田園東-松崗 | - | - | 7 | |
| 南寶線)(松崗-左炮臺東 | 33 | |||
| 地鐵8號線三期 | 小梅沙-溪涌 | - | - | 2 |
| 溪涌-小梅沙 | - | - | 2 | |
| 地鐵8號線二期 | 小梅沙-鹽田路 | - | - | 5 |
| 鹽田路-小梅沙 | - | - | 5 | |
| 地鐵15號線內環 | 前保-前保 | - | - | 25 |
| 地鐵7號線二期 | 西麗湖-學府醫院 | - | - | 3 |
| 學府醫院-西麗湖 | - | - | 3 | |
| 地鐵15號線外環 | 前保-前保 | - | - | 25 |
本市的地鐵經過深圳9個地區，分別為(括號為地鐵站個數)：龍崗區（95個）、福田區（87個）、寶安區（83個）、南山區（110個）、羅湖區（40個）、鹽田區（11個）、龍華區（27個）、光明區（29個）、坪山區（18個）。
深圳地鐵線路圖